Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4orf36Q96KX1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms