Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLMNQ96JQ2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms