Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTV1Q96GA3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LTV1Q96GA3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms