Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGF29Q96ES7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SGF29Q96ES7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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