Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHFRQ96EP1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHFRQ96EP1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms