Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPSB1Q96BD6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPSB1Q96BD6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms