Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EXOSC8Q96B26 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms