Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM63Q969Q1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms