Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RFKQ969G6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms