Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms