Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PRG4Q92954 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRG4Q92954 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRG4Q92954 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRG4Q92954 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRG4Q92954 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms