Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRUQ92729 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRUQ92729 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms