Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RABGGTAQ92696 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms