Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF3AQ92664 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms