Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAAF4Q8WXU2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms