Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HELBQ8NG08 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms