Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF439Q8NDP4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF439Q8NDP4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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