Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AVL9Q8NBF6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AVL9Q8NBF6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms