Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC4Q8N9L1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms