Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RNF182Q8N6D2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RNF182Q8N6D2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms