Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SVOPQ8N4V2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms