Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG9AQ7Z3C6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms