Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TCF23Q7RTU1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms