Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC80Q76M96 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC80Q76M96 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms