Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP53Q70EK8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP53Q70EK8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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USP53Q70EK8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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USP53Q70EK8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP53Q70EK8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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