Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC9Q6ZRR7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRRC9Q6ZRR7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms