Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CASC2Q6XLA1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms