Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXD4L3Q6VB84 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms