Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms