Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms