Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL35Q6PF15 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL35Q6PF15 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms