Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6P435 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6P435 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q6P435 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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