Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC9A4Q6AI14 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC9A4Q6AI14 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms