Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF123Q5XPI4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms