Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLX4IPQ5VYV7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms