Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAB6CQ53S08 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAB6CQ53S08 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms