Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLHL12Q53G59 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms