Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf46Q504U0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms