Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TBRG1Q3YBR2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms