Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP27-1Q3LI81 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms