Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC57Q2TAC2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC57Q2TAC2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms