Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SKIDA1Q1XH10 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKIDA1Q1XH10 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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