Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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PTPRNQ16849 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PTPRNQ16849 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRNQ16849 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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