Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPROQ16827 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPROQ16827 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPROQ16827 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPROQ16827 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPROQ16827 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPROQ16827 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PTPROQ16827 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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