Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RTN1Q16799 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RTN1Q16799 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RTN1Q16799 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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RTN1Q16799 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTN1Q16799 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RTN1Q16799 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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RTN1Q16799 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTN1Q16799 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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