Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HIF1AQ16665 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HIF1AQ16665 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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