Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
E2F4Q16254 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms