Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CST6Q15828 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CST6Q15828 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CST6Q15828 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CST6Q15828 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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CST6Q15828 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CST6Q15828 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CST6Q15828 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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