Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HMGN3Q15651 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HMGN3Q15651 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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