Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP13Q15645 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms